quarta-feira, 2 de abril de 2014

My Autossomal Gedematch Harappa Project Admixture Oracles Results



Meus resultados autossômica Gedematch Harappa Projeto Mistura Oráculos




Meus resultados autossômica Gedematch Harappa Projeto Mistura Oráculos

GEDmatch.Com a Oracle

Este programa é baseado no "Oráculo v1 'por Dienekes Pontikos. Seu programa original é

desenvolvido como parte do Projeto Dodecad Ancestrais. Mais informações sobre Dienekes '
programa orignal pode ser encontrada aqui.
Muito obrigado também a Zack Ajmal para nos ajudar a obter esta versão web do Dienekes 'da Oracle
programa desenvolvido.

Resultados HarappaWorld Oracle:
23 abril de 2013 - Oracle percentagens de população de referência revistos.
Kit F214911

Resultados Admix (ordenados):
Percent # População
1 W-Africano 68,8
2 Mediterrâneo 7,17
3 NE-Euro 6.1
4 E-Africano 4,85
5 Pigmeu 3,88
6 American 3,61
7 San 1.8
8 brancas 1,29
9 Baloch 1,15
10 SW-asiático 0,58
11 S-indianas 0,45
Beringian 12 00:33

Compartilhamento Simples População:
# População (fonte) Distância
Um africano-americano (1000genomes) 6,71
2 fim (henn2012) 17.96
3 Fang (henn2012) 18.08
4-africano Caribe (1000genomes) 18.66
5 fulani (henn2012) 20.08
6 pombo (henn2012) 20.34
7 bantusouthafrica (HGDP) 20.65
8 pedi (xing) 20.65
9 nguni (xing) 21.63
10 Bamoun (henn2012) 22.44
11 bantukenya (HGDP) 25.96
12 mandenka (HGDP) 26.24
13 Siddi (Reich) 26.71
14 hausa (henn2012) 27.07
15 Luhya (hapmap) 27.36
16 Luhya (1000genomes) 27.78
17 mandatado (henn2012) 28.97
18 Igbo (henn2012) 29.11
19 bambaran (xing) 29.65
20 brong (henn2012) 30.35

Mixed Mode Sharing População:
# Primárias População (fonte) População secundário (fonte) Distância
1 62,3% Bamoun (henn2012) + 37,7% dominicanos (Bryc) @ 3.11
2 75,4% Bamoun (henn2012) + 24,6% de Puerto Rico-
() @ 3,26 1000genomes
3 64,6% Congo (henn2012) + 35,4% dominicanos (Bryc) @ 3.53
4 92,8% africano-americano
(1000genomes) + 7,2% Sandawe (henn2011) @ 3.89
5 94% africano-americano
(1000genomes) + 6% hadza (henn2011) @ 3.97
6 77,3% Congo (henn2012) + 22,7% de Puerto Rico-
() @ 4,08 1000genomes
7 90,2% africano-americano
(1000genomes) + 9,8% fechado Hema (Xing) @ 4.1
8 89,6% africano-americano
(1000genomes) + 10,4% alur (Xing) @ 4.14
9 94,7% africano-americano
(1000genomes) + 5,3% Wolayta (Pagani) @ 4.21
10 94,5% africano-americano
(1000genomes) + 5,5% de Maasai (1000genomes) @ 4.23
11 95% africano-americano
(1000genomes) + 5% aricultivator (pagãos) @ 04:23
12 94,5% africano-americano
(1000genomes) + 5,5% a Somália (Reich) @ 4.24
13 94,6% africano-americano
(1000genomes) + 5,4% Oromo (Pagani) @ 4.25
14 95,1% africano-americano
(1000genomes) + 4,9% ariblacksmith (Pagani) @ 4,26
15 77% Bamoun (henn2012) + 23% colombianos (1000genomes) @ 4.28
16 94,8% africano-americano
(1000genomes) + 5,2% esomali (Pagani) @ 4,28
17 94,8% africano-americano
(1000genomes) + 5,2% a Somália (Pagani) @ 4.29
18 94,6% africano-americano
(1000genomes) + 5,4% ao longe (Pagani) @ 4.3
19 94,8% africano-americano
(1000genomes) + 5,2% a Somália (Harappa) @ 4.31
20 94,5% africano-americano
(1000genomes) + 5,5% Etíope (Behar) @ 4.31

Gedmatch.Com
HarappaWorld 4-Antepassados ​​da Oracle
Este programa baseia-se em 4 Antepassados ​​Oracle Versão 0.96 por Alexandr Burnashev.
Perguntas sobre os resultados devem ser enviados para ele em: Alexandr.Burnashev @ gmail.com
Conceito original proposto por Sergey Kozlov.
Muito obrigado a Alexandr para nos ajudar a conseguir esta versão web desenvolvido.
Revisado: 06 de dezembro de 2012
Modo de 16 componentes.
Limite de componente auto-definido para 0,760%. Admix resultados abaixo desse valor não será
considerado.

Número Kit: F214911
Resultados Admix (ordenados):
Percent # População
1 W-Africano 69.75
2 Mediterrâneo 7,27
3 NE-6.18 Euro
4 E-Africano 4,92
5 Pigmeu 3,93
6 American 3.66
7 San 1,82
8 brancas 1,30
9 Baloch 1,17
--------------------------------
Método dos mínimos quadrados.
Usando uma aproximação da população:
1 african-american@6.218
2 fang@17.210
3 african-caribbean@17.574
4 kaba@17.697
5 pedi @ 18.333
6 bantusouthafrica@18.389
7 nguni@19.332
8 kongo@19.443
9 fulani@21.468
10 bamoun@21.535
377 iterações.

Usando duas populações de aproximação:
1 50% africano-americano 50% african-american@6.218
2 50% 50% dominicana yoruba@7.176
3 50% 50% dominicana yoruba@7.190
4 50% 50% dominicana yoruba@7.236
5 50% 50% dominicana igbo@7.485
6 50% 50% dogon dominican@7.504
7 50% 50% dominicana hausa@7.519
8 50% 50% brong dominican@7.528
9 50% 50% bambaran dominican@7.577
10% 50% 50 mandenka@8.161 Dominicana
71.253 iterações.

Usando três populações de aproximação:
Puerto-rican@2.998 1 50% +25% Bamoun fim +25%
2 50% hausa +25% +25% presa puerto-rican@3.141
3 50% pombo africano-americano +25% +25% dominican@3.147
4 50% presa +25% +25% hausa puerto-rican@3.281
5 50% pombo +25% +25% puerto-rican@3.287 africano-caribenha
6 50% kongo +25% hausa +25% puerto-rican @ 3.327
7 50% kongo +25% hausa +25% puerto-rican @ 3.335
8 50% Bamoun +25% +25% HAUSA ESTADOS puerto-rican@3.371
9 50% pombo +25% +25% mandenka puerto-rican@3.373
Puerto-rican@3.427 10 50% +25% Igbo fim +25%
435.964 iterações.

Usando quatro populações de aproximação:

1 Bamoun africano-americano + + + kaba@2.423 Dominicana
2 brong + fang + kaba + puerto-rican @ 2.659
3 africano-americano + Dominicana + final + kongo@2.661
4 fang + kaba + puerto-rican + yoruba @ 2.735
5 fang + kaba + puerto-rican + yoruba @ 2.743
6 presa Floresta + + + vestido puerto-rican@2.753
7 fang + kaba + puerto-rican + yoruba @ 2.775
8 africano-caribenha + Bamoun + + Kaba puerto-rican@2.788
9 igbo + kaba + kongo + puerto-rican @ 2.821
Bambara 10 + fang + Vestido + puerto-rican@2.830
11 brong + kaba + kongo + puerto-rican @ 2.854
12 dogon + fang + kaba + puerto-rican @ 2.869
13 africano-americano + Dominicana + + fang kaba@2.967
14 bamoun + kaba + puerto-rican + yoruba @ 2.974
15 bamoun + igbo + kaba + puerto-rican @ 2.984
16 bamoun + kaba + puerto-rican + yoruba @ 2.991
17 bambaran + kaba + kongo + puerto-rican @ 2.994
18 bamoun + bamoun + kaba + puerto-rican @ 2.998
19 african-caribbean + igbo + kaba + puerto-rican @ 3.010
20 bamoun + brong + kaba + puerto-rican @ 3.015
18404227 iterações.
Concluído.
Tempo decorrido 12,4326 segundo.

Gedmatch.Com
HarappaWorld Oracle x População Montagem
Este programa é baseado em planilha População montagem de Larry Smiser.
Perguntas sobre o método ou os resultados devem ser enviados para ele em lwsmiser@gmail.com
Terminei de ler dados populacionais. 377 populações encontrado.
16 aglomerados populacionais.
Número Kit: F214911
Resultados Admix:
Percent # População
Uma S-indianas 0,45
2 Baloch 1,15
3 Caucasiano 1,29
4 NE-6.10 Euro
5 SE asiático 0,00
6 Siberian 0,00
7 O NE-0.00
8 Papua 0,00
9 americano 3,61
10 Beringian 00:33
11 Mediterrâneo 7,17
12 SW-asiático 0,58
13 San 1,80
14 4,85 E-Africano
15 Pigmeu 3,88
16 68.80 W-Africano

Pct. Calc. Opção 2
1 africano-americano 64,93%
2 Brong 15,58%
3 aricultivator 5,17%
4 biakapygmy 3,70%
5 Suruí 3,63%
6 bantusouthafrica 3,44%
7 Sardenha 2,25%
8 tunisia 1,09%
9 dominicana 0,20%
10 colombian 0,01%
RMSD Total: 0.798651
Tempo decorrido 0,7343 segundo.

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